Crise de identidade profissional do farmacêutico e, em consequência, com reconhecimento social e sua muita inserção na equipe multiprofissional de saúde, que representando um referencial como profissional de saúde na farmácia.

Embora existam definições legais referentes à Assistência Farmacêutica e à política de medicamentos, há problemas referentes à sua efetiva implementação, incluindo-se a definição de mecanismos e instrumentos para a sua organização, avaliação e possíveis redirecionamentos.

Associação entre os interesses econômicos e os interesses da saúde coletiva, com predomínio dos primeiros, resultando na caracterização da farmácia como estabelecimento comercial e do medicamento como um bem de consumo, desvinculados do processo de atenção à saúde.

Prática profissional desconectada das políticas de saúde e de medicamentos, com priorização da educação em saúde e da orientação sobre o uso de medicamentos em detrimento das atividades administrativas.

Deficiências na formação, pouco tecnicista, com incipiente formação na área clínica. Descompasso entre a formação dos farmacêuticos e as demandas dos serviços de atenção à saúde, tanto públicos como privados e nos diferentes níveis, bem como daquelas referentes ao setor produtivo de medicamentos e insumos necessários ao âmbito da saúde. Falta de diretrizes e escassez de oportunidades de educação continuada.