Presença de ribossomos livres e aderidos à membrana do retículo endoplasmático rugoso é uma característica exclusiva da célula eucariótica, uma vez que a célula procariótica não apresenta organelas membranosas.

No citoesqueleto de ambas as células são encontrados microtúbulos de tubulina, filamentos de actina e filamentos intermediários.

A carioteca delimita o núcleo celular onde está armazenado o material genético de células eucarióticas. Nas procarióticas, o DNA fica mergulhado no citoplasma.

Bactérias fotossintetizantes, como as cianobactérias ou algas azuis, apresentam clorofila, mas não cloroplastos.

A membrana plasmática está presente em ambas as células, sendo constituída de uma bicamada fosfolipídica, impermeável para entremeada por proteínas.