A farmácia hospitalar é uma unidade clínica, administrativa e econômica, dirigida por farmacêutico, ligada hierarquicamente à gerência de assistência farmacêutica e integrada funcionalmente com as demais unidades administrativas e de assistência ao paciente.

A direção técnica da farmácia hospitalar é responsabilidade exclusiva do farmacêutico e deve ser exercida, obrigatoriamente, por farmacêutico especialista em farmácia clínica regularmente inscrito no Conselho Regional de Farmácia.

A farmácia hospitalar compreende a seleção de medicamentos, a aquisição e o controle dos medicamentos selecionados e o estabelecimento de um sistema racional de distribuição que assegure que o medicamento prescrito chegue ao paciente na dose correta.

Em hospitais com 200 leitos ou mais, é imperativa a instalação de um Centro de Informações sobre Medicamentos (CIM) em local independente, com a designação de um farmacêutico responsável em tempo integral.