Para a coleta de secreções nasais é obrigatório o uso de anestésicos para minimizar o desconforto animal.

Cistocentese é uma técnica considerada inadequada para a coleta de urina de animais roedores e lagomorfos.

Amostras de leite devem ser colhidas após a limpeza e secagem da (s) teta (s), de preferência com o uso de antissépticos.

O procedimento para a coleta de urina de animais pode ser realizado por meio da micção do animal consciente; via catéter urinário, mediante anestesia geral, com o uso de gaiola metabólica, entre outras.

A coleta de fezes é muito utilizada para medir o teor de alguns hormônios e presença de parasitas de forma relativamente não invasiva e para detectar sinais de doença infecciosa. Estudos qualitativos requerem que todas as fezes sejam coletadas ao longo de um período determinado (normalmente 24 horas).