Um ecobatímetro monofeixe emite sinais acústicos através de seu transdutor. Esse sinal vai do transdutor até o fundo e retorna para a superfície, e a profundidade local é calculada pelas variáveis velocidade do som na água; e tempo do percurso do sinal sonoro entre o equipamento e o fundo.

Para medição da profundidade, a escolha da frequência do ecobatímetro depende da profundidade local. Normalmente, maiores frequências são utilizadas para maiores profundidades.

Um ecobatimeiro multifeixe é considerado uma extensão do ecobatímetro monofeixe, transmitindo uma faixa de feixes por medição. O equipamento apresenta uma precisão tão alta que não é necessário realizar correções na batimetria devido às oscilações na embarcação de coleta.

O sonar SIDESCAN possibilita a medição da "sonificação”" do fundo. A qualidade das imagens combinada com a baixa frequência utilizada velo equipamento permite obter informações de alta resolução do fundo, podendo permitir a detecção de irregularidades ou obstáculos no fundo.

Por utilizarem maiores frequências que os ecobatímetros, os perfiladores de subfundo permitem obter informações da estrutura sedimentar das camadas mais superiores do fundo.