Microscópio de campo claro usa luz ultravioleta para iluminar a amostra, permitindo que objetos corados com corantes fluorescentes sejam observados.

Microscópio eletrônico de varredura possui feixe de elétrons, realiza uma varredura, um “escaneamento” da superfície da amostra revestida por metal e é gerada uma imagem tridimensional.

Microscópio eletrônico de transmissão possui sistemas de iluminação e vácuo que produzem feixes de elétrons de alta energia.

Microscópio óptico de contraste de fase é melhor para visualizar células não coradas.

Microscópio eletrônico de transmissão fornecem imagem planas, a imagem é ampliada e focada em um dispositivo de imagem, como uma tela florescente e visualizado com um vidro de proteção, ou é projetada em um monitor.