Mesmo sendo da mesma fabricante, a Adobe, a compatibilidade entre o InDesign e o Illustrator não permite que objetos vetoriais sejam intercambiados entre os dois softwares por meio do comando copiar e colar.

A extensão .idml pertence ao software Adobe InDesign e a sua grande vantagem é a retrocompatibilidade, ou seja, o mesmo arquivo pode ser aberto em versões mais antigas do mesmo software.

Um arquivo produzido no Adobe Photoshop e salvo no formato PSD não pode ser importado no CorelDraw devido à incompatibilidade entre diferentes fabricantes.

Ao encaminhar para a gráfica arquivos abertos produzidos no Adobe InDesign, é necessário apenas o envio das imagens, além do arquivo .indd, já que as fontes não convertidas em curva estão embutidas no arquivo original.

A produção do layout de uma revista deve ser iniciada e finalizada por completo no mesmo software, já que os softwares têm mecanismos de gerenciamento de cores específicos e incompatíveis entre si.