Na ELISA direto, um único anticorpo marcado é utilizado para detectar o antígeno, enquanto na ELISA indireto, dois anticorpos são utilizados, um primário e outro secundário

A ELISA direto requer uma etapa adicional de lavagem em comparação com a ELISA indireto

Na ELISA direto, o antígeno é marcado, enquanto na ELISA indireto, o anticorpo é marcado

A ELISA indireto é mais sensível que a ELISA direto devido ao uso de dois anticorpos

Na ELISA direto, a detecção é feita através da mudança de cor, enquanto na ELISA indireto, a detecção é feita através de fluorescência