A clorexidina, agente não-iônico com propriedades hidrofílicas e hidrofóbicas, é bactericida em altas concentrações, acarretando extravasamento de constituintes celulares com baixo peso molecular e precipitação dos conteúdos celulares. Em baixas concentrações, seu efeito é bacteriostático, provocando interferência nas funções normais da membrana ou no extravasamento de constituintes celulares.