A rastreabilidade animal é realizada de forma eletrônica enquanto a rastreabilidade vegetal deve ser executada manualmente, passando a forma eletrônica apenas quando da chegada do produto à gôndola do mercado.

A rastreabilidade deve ser aplicada aos produtos agrícolas da pauta de exportação, entretanto impede a comercialização quando aplicada aos produtos agrícolas de consumo interno.

A rastreabilidade só tornou-se possível graças ao advento da biotecnologia e da nanotecnologia.

Os sistemas de Produção Integrada de Frutas (PIF), fomentados pelo Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) exigem a rastreabilidade como um de seus processos.

O fator limitante à adoção da rastreabilidade é a elaboração e colocação do código de barras nos produtos agrícolas desde a fase em que se encontram no campo.