O fitoplâncton varia em função dos fatores ambientais, hidrológicos e autogênicos. Em reservatórios, as mudanças do fitoplâncton conduzem às interpretações ambientais e ao diagnóstico da qualidade da água. O fitoplâncton qualitativo deve ser coletado com rede de plâncton (45µm) e o fitoplâncton quantitativo deve ser coletado diretamente na sub-superfície da água. O fitoplâncton é então analisado em microscopia ótica e são aplicados os valores de riqueza de espécies e dominância (D) e os índices de diversidade de Shannon (H’) e Equabilidade de Pielou (E).

Nesse tipo de estudo são obtidas informações sobre