Nos zigotos dos cordados ocorrem sucessivas divisões mitóticas, após 5 divisões o embrião, de 64 células, forma um maciço de células denominado gástrula.

O processo de invaginação ocorre durante alguns tipos de gastrulação, em que a zona da blastoderme correspondente ao polo vegetativo, se invagina, afundando-se ativamente até chegar ao contato com a zona oposta.

No início da gastrulação o embrião se denomina gástrula, havendo então a diferenciação dos tecidos (endoderme e ectoderme).

No processo de embolia, a camada interna forma a ectoderme. Essa situação ocorre nos cordados inferiores e equinodermos.

O processo de gastrulação por migração ocorre quando alguns blastômeros isolam-se e migram para a blastocele, vindo a unir-se e a originar a mesoderme, que ficará rodeada pela ectoderme.