As vacinações contra Febre Aftosa, de fiscalização pela Agência de Defesa Agropecuária do Estado do Tocantins, obedecem às etapas: a vacinação no mês de maio (todo o rebanho) e a de novembro (animais até 24 meses de idade), sendo o estado classificado como livre com vacinação.

São viroses em aves que podem ser controladas através de vacinação: a doença de Marek, a doença de Gumboro, doença de Newcastle, bronquite infecciosa das aves e varíola aviária.

No controle a Brucelose deve-se vacinar fêmeas de 3 a 8 meses com a cepa B19 e, com autorização da Agência de Defesa Agropecuária do Estado do Tocantins, animais fora da idade prevista, inclusive machos, com a cepa RB51.

A vacinação de raiva é obrigatória somente em regiões endêmicas, ou quando determinada pelo órgão sanitário estadual.

São vacinas previstas em um programa de vacinação de suínos: parvovirose, colibacilose, rinite atrófica e pneumonia enzoótica.