A educação indígena foi interrompida com a chegada dos jesuítas, os quais se dedicaram à pregação da fé católica e ao trabalho educativo, pois perceberam que não seria possível converter os indígenas à fé católica sem que soubessem ler e escrever.

Ao mesmo tempo em que suprimia as escolas jesuíticas de Portugal e de todas as colônias, Benjamim Constant criava as aulas régias de Latim, Grego e Retórica, bem como a Diretoria de Estudos que só passou a funcionar após o afastamento dele. Cada aula régia era contextualizada, sendo o professor mediador das aprendizagens.

No Período Moderno, os jesuítas foram expulsos do Brasil, levando consigo a organização monolítica baseada nas práticas contextualizas. Dessa ruptura, pouca coisa restou da prática educativa no Brasil, pois D. João pensava em reerguer Portugal da decadência que se encontrava diante de outras potências europeias da época.

Durante o Período Pombalino brasileiro (1822-1889), a educação era caracterizada por uma estrutura centralizada e elitista. O sistema educacional estava sob controle da Igreja Católica, com ênfase na formação de elites e no ensino religioso. A instrução pública era ampla, inclusiva e disponível para todos (crianças, jovens e adultos).

No período da Segunda República, a organização escolar recebeu influência da Filosofia Positivista. A Reforma de Pombal tinha como princípios orientadores a liberdade e a laicidade do ensino, bem como a gratuidade da escola primária.