Devido às diferenças notáveis, é possível realizar diagnóstico radiográfico diferencial entre cisto e granuloma.

Diante de um abscesso apical agudo, se o paciente apresenta tumefação inicial, deve-se orientar aplicação de calor na face e bochechos com água fria, para evitar que a drenagem do abcesso ocorra através da pele.

O granuloma periapical surge em resposta a estímulo nocivo de alta intensidade, proveniente do canal radicular.

Uma lesão no periápice pode ser diagnosticada como cisto, quando apresenta epitélio oriundo dos restos epiteliais de Malassez.