Para amostras viscosas, o pH de uma pequena alíquota do sêmen não pode ser medido, pois o resultado não será fidedigno devido à baixa homogeneidade que a amostra viscosa apresenta.

O pH deve ser medido antes da liquefação, imediatamente após a ejaculação .

O pH deve ser medido após a liquefação, a um tempo uniforme, de preferência após 30 minutos; mas, em qualquer caso, dentro de até 3 horas após a ejaculação.

O pH menor que 7,0 em uma amostra de sêmen com baixo volume e baixo número de espermatozóides pode indicar obstrução do ducto ejaculatório ou ausência congênita bilateral do ducto deferente.