Estágio Catarral: a pertussis começa com sintomas indistinguíveis dos de uma infecção do trato respiratório viral de pequena intensidade, como febre baixa, tosse intermitente a noite e espirros.

Estágio Paroxístico: após 7 a 14 dias do início a tosse fica mais frequente, e, depois paroxística e com uma inspiração ruidosa do ar. Os paroxismos são acompanhados de edema periorbital, conjuntivas ingurgitadas, hemorragia, petéquias na testa e epistaxe.

Estágio Intersticial: após 15 a 20 dias do seu início ocorre o enfisema intersticial, podendo evoluir para pneumonia primária ou secundária, além disso o vômito recorrente pode levar a alcalose metabólica e, às vezes, podem haver acessos de asfixia e episódios de apnéia.

Estágio Convalescente: o paroxismo torna-se menos frequente e menos intenso, o vômito cessa e ocorre recuperação lenta. A convalescença requer de 4 a 12 semanas.