o Filo Basydiomicota engloba mais de 22.000 espécies, destacando-se as trufas, representadas no gênero Tuber, que se reproduzem assexuadamente por zoósporos e fragmentação e apresentam esporo sexuado do tipo basidiósporo.

o principal Filo é o Ascomycota, destacando-se os fungos venenosos do gênero Amanita que reproduzem-se assexuadamente com zoósporos móveis ou fragmentação e o esporo sexuado está armazenado dentro do zigosporângio.

possuem um grupo artificial, os Fungos Conidiais ou imperfeitos, tais como Aspergillus e Penicillium e apenas a forma de reprodução assexuada (fase anamorfa) é conhecida ou utilizada na sua classificação.

o Filo Clytridiomycota, com menor número de representantes, possui reprodução assexuada por brotamento e conídios e o esporo sexuado é móvel.

no Filo Zygomycota estão agrupadas as endomicorrizas do gênero Glomus, que se reproduzem assexuadamente através de esporos móveis e brotamento e não apresentam esporo sexuado.