Um scanner de alimentação automática é mais compacto e portátil do que um scanner de alimentação automática, o que o torna mais conveniente para uso em viagens e deslocamentos.

Um scanner de mesa é projetado especificamente para digitalizar fotos e imagens coloridas, enquanto um scanner de alimentação automática é mais adequado para documentos de texto em preto e branco.

Um scanner de mesa é utilizado para digitalizar documentos individuais colocados manualmente no vidro do scanner, enquanto um scanner de alimentação automática é capaz de digitalizar automaticamente várias páginas em sequência, sem a necessidade de intervenção do usuário.

Só um scanner de mesa oferece a função de envio do documento diretamente ao e-mail.

Um scanner de mesa é capaz de enviar diretamente os documentos digitalizados para uma impressora, enquanto um scanner de alimentação automática requer a transferência manual dos arquivos para um dispositivo de armazenamento.