Na infecção do sistema nervoso central por citomegalovírus (CMV), as calcificações, em geral periventriculares, são detectadas em mais de 80% dos casos e são caracterizadas de maneira mais nítida por meio da ressonância magnética.

Encefalite crônica com inflamação e edema do tecido cerebral são achados patológicos relacionados à encefalite herpética, incluindo-se ainda necrose tecidual focal com eventuais áreas hemorrágicas, vasculite e infiltrados meníngeos linfocitários.

Encefalite subaguda, cuja incidência em autópsia varia entre 20% e 40%, é a manifestação neuropatológica mais comum da infecção por HIV.

Em crianças acometidas pelo HIV, a tomografia computadorizada evidencia redução dimensional ventricular (achado mais comum), hipotrofia cortical, hiperatenuação da substância branca e calcificações cerebelares.