Com relação ao controle de pragas, além do controle biológico natural, existem o controle biológico clássico e o aplicado, e ambos se referem à importação e colonização de inimigos naturais, visando ao controle de “pragas” exóticas ou nativas.

Quando se aumenta a diversidade de espécies vegetais em um agroecossistema, é possível favorecer a existência natural de inimigos das “pragas”, que atuarão no controle biológico, sem a necessidade da aplicação de insumos químicos ou bioinsumos introduzidos.

Os riscos da utilização de bioinsumos vão, desde problemas com resíduos e introdução de patógenos até, a possibilidade de reações imprevisíveis, devido à interação com outros organismos.

Depreende-se que a utilização ou, mesmo, o acesso à nova tecnologia de bioinsumos por si, não poderá oferecer vantagens para além das perspectivas ambientais e econômicas. Não podendo, portanto, ser reconhecida como alternativa sustentável no sentido pleno do termo, se não reconhecer também aspectos sociais.

O recomendável é que os agroecossistemas produzam seus próprios bioinsumos para o controle biológico, por meio apenas da diminuição da diversidade de espécies vegetais, a fim de evitar a dependência de insumos externos.