Os animais protostômios incluem, além do filo Nematoda, outros filos animais, que se subdividem em dois grandes táxons: os Lophotrochozoa e os Ecdysozoa. O grupo Ecdysozoa, com base em caracteres moleculares, é considerado monofilético e inclui animais, como nematódeos, insetos, aracnídeos, crustáceos, entre outros, que têm como uma das características principais: