Os microorganismos presentes no solo podem favorecer a qualidade do solo, além de potencializar a produção vegetal. Um grupo de extrema importância na avaliação de qualidade do solo ocorre através da associação entre fungos e raízes, aumentando a absorção de nutrientes e a quantidade de açúcares produzidos. Este grupo faz com que as plantas absorvam maior quantidade de nutrientes e sais minerais, ao mesmo tempo, reduz a quantidade utilizada de fertilizantes e venenos. Este grupo são: