A elaboração do Zoneamento Ecológico-Econômico se dá em três instâncias distintas, iniciando com os estudos em escala nacional e em seguida os governos estaduais e, por fim, as cidades fazem o mesmo para elaborar seus zoneamentos locais. As escalas de trabalho e os produtos gerados variam entre aqueles de âmbito nacional, próxima da escala geométrica de: