As fissuras faciais podem ser unilaterais ou bilaterais. Os dois tipos de fissuras mais comuns são: a fissura labial, e a fissura palatina.

A fissura labial resulta da falha da fusão entre a proeminência maxilar e o processo intermaxilar. A extensão e profundidade das fissuras labiais podem variar consideravelmente.

A fissura palatina é causada por um crescimento inadequado da lâmina palatina ou pela falha da fusão destas lâminas ao longo da linha mediana.

Entre os tipos de fissuras estudos indicam uma incidência de 50 % de fissuras de lábio isoladas, 25% de fissuras lábiopalatinas e 25 % de fissuras palatinas.

Estatisticamente há preferência pelo lado esquerdo nas fissuras labiais, predominância pelo sexo masculino nas fissuras labiopalatinas e pelo sexo feminino nas fissuras isoladas do palato.