Os agentes descalcificadores ácidos devem ser usados quando se deseja preservar enzimas e ácidos nucleicos presentes nos tecidos ósseos.

Quando se necessita de uma descalcificação urgente, é recomendado o uso de métodos histoquímicos.

Os descalcificadores à base de ácidos fortes mais usados são o ácido acético e o ácido fórmico.

As resinas de troca iônica são descalcificadores de ação rápida, que preservam os detalhes celulares.

O uso de agentes quelantes como descalcificadores tem como desvantagem a produção de artefatos.