O que diferencia o Staphylococcus aureus meticilina-resistente (MRSA) do meticilina-sensível (MSSA) é a produção de exotoxinas pelo primeiro, a qual, além de causar resistência antibiótica, aumenta a gravidade clínica das infecções por MRSA.

A resistência aos carbapenêmicos induzida pela produção de carbapenenase (KPC) é restrita às espécies do gênero Klebsiella. Deve-se minimizar a prescrição inadvertida de carbapenêmicos nas instituições em que esse gênero seja prevalente.

A Pseudomonas aeruginosa é uma preocupação na cobertura antibiótica de infecções hospitalares, especialmente em infecções respiratórias. Porém, esse germe raramente apresenta resistência a múltiplos antimicrobianos, e as infecções por ele causadas apresentam alta taxa de sucesso às terapias empíricas.

O Acinetobacter baumannii era uma grande preocupação na era prévia ao surgimento das bactérias produtoras de carbapenenase (KPC), mas não mais nos dias atuais. Isso indica uma competição direta entre essas duas bactérias, que foi vencida pela KPC.

Nas infecções do trato urinário, as enterobactérias produtoras de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL) passam a ter relevância. A alta prevalência desses germes aumenta a indicação de carbapenêmicos na terapia empírica inicial.