Diferentes patógenos ameaçam a estabilidade dos rebanhos, submetendo o setor pecuário ao desafio constante de manter rebanhos sanitariamente controlados prevenindo doenças, erradicando patógenos específicos e produzindo alimentos livres de contaminantes. São doenças que podem afetar a produção e a sanidade animal, gerando prejuízos na produtividade: