O diagnóstico da bola fúngica é confirmado pelo exame histopatológico que revela o emaranhado de fungos, que invade a submucosa, determinando intenso processo infamatório com exudato fibrinonecrótico ao redor.

Estão sempre relacionadas a um paciente imuno deprimido ou imuno deficiente.

Há sempre invasão da submucosa na avaliação histopatológica, podendo manifestar-se clinicamente de forma indolente ou agressiva.

A Alternaria e o Bipolaris são os fungos mais prevalentes da mucormicose.

No material de sinusite fúngica alérgica observa-se hifas fúngica dispersas em material mucinoso com eosinófilos abundantes, não sendo observada invasão da submucosa por fungos.