Os resíduos no ambiente, ainda que em escalas diminutas, podem afetar a base da cadeia alimentar, como os micro-organismos e pequenos peixes, no entanto, não se observam efeitos no restante da cadeia, em detrimento destas baixas concentrações

A presença de hormônios femininos na água pode levar a feminização de peixes e a formação de óvulos em animais machos, indicando que mesmo pequenas quantidades do estrogênio usado em pílulas anticoncepcionais podem levar ao colapso de algumas espécies

Enquanto alguns fármacos são completamente removidos pelo tratamento tradicional, outros têm somente uma remoção parcial

Uma das classes mais preocupantes de contaminantes emergentes são os interferentes endócrinos

Um grande problema, se não o maior, que pode ser causado pela contaminação de fármacos se refere ao desenvolvimento de superbactérias resistentes a antibióticos