Após a cirurgia para o megaesôfago, mesmo com a melhora clínica, o paciente deve manter o rastreio com EDA rotineira devido ao risco de câncer do esôfago.

Nas úlceras gástricas devemos evitar a biópsia em um primeiro momento devido ao risco de sangramento. Após o tratamento com inibidor de bomba de próton, repete-se o exame e caso não haja a cicatrização da úlcera realiza-se biópsias de pelo menos 8 fragmentos devido ao risco de malignidade da lesão.

O esôfago é um órgão de passagem com pouco tempo de contato do alimento com a sua mucosa, este tempo curto faz com que os hábitos alimentares não interfiram no risco de surgimento do câncer esofágico.

A estenose cáustica por aumentar o tempo de contato do alimento com a mucosa esofágica, aumentam a incidência do câncer esofágico principalmente nos primeiros anos da lesão cáustica.