A cápsula endoscópica é contraindicada em pacientes com histórico de cirurgia abdominal devido ao risco aumentado de perfuração.

A enteroscopia com balão duplo permite intervenção terapêutica, como polipectomia ou dilatação, mas é limitada a exames do jejuno proximal.

A enteroscopia por propulsão (push enteroscopy) é o método preferido para a avaliação de sangramento oculto de origem obscura no intestino delgado.

A cápsula endoscópica pode ser utilizada como procedimento diagnóstico inicial em pacientes com suspeita de doença de Crohn não diagnosticada por endoscopia convencional.