Recomenda-se organizar os medicamentos primeiramente por nível de utilização e dentro da mesma classe, em ordem alfabética seguindo o nome fantasia ou o nome de marca.

Medicamentos controlados, classificados na Portaria nº 344/ 98 devem ser armazenados em sala da gerência, trancada, com a acesso exclusivo para ele ou para o farmacêutico.

Quando os produtos forem ordenados de acordo com o critério de data de validade, o melhor sistema é o FIFO – primeiro que entra, primeiro que sai.

Quando os produtos forem ordenados de acordo com o critério de entrada, o melhor sistema é o FEFO – “primeiro que vence, primeiro que sai” e os medicamentos que chegam primeiro são alocados à frente daqueles que chegam posteriormente.

Quando a farmácia utiliza o sistema FEFO – “primeiro que vence, primeiro que sai”, os medicamentos que vencem primeiro devem ser alocados à frente daqueles com data de vencimento posterior.