As anomalias do arco aórtico podem provocar compressões extrínsecas da traqueia e problemas respiratórios, bem como, compressão esofágica e disfagia.

Na hipoplasia pulmonar há presença de ambos os pulmões, porém, o número de dicotomizações de sua árvore brônquica é bastante reduzido, fazendo que seu volume e área respiratória sejam reduzidos.

A atresia de coana consiste na persistência de um septo membranoso (10% dos casos) ou ósseo (90%) que oclui a coana.

Traqueomalácia e bronquiomalácia são frequentes; decorrem de imaturidade do esqueleto cartilaginoso que não são adequadamente rígidos, permitindo o colabamento da via aérea durante a inspiração.

As membranas e estenoses de traqueias de pequena extensão não respondem bem ao tratamento dilatador via endoscópica, devido a rigidez destas malformações.