Foi criado para conferir mais robustez e sustentabilidade comercial às propostas aprovadas no âmbito do Programa PIPE-FAPESP, possuindo um fluxo de 5 fases.

A primeira fase inicia-se com a Clara Demonstração de interesse e comprometimento dos beneficiários do PIPE Fase 1 com o sucesso, não apenas científico e tecnológico, mas também comercial do projeto.

Na segunda fase ocorre a seleção de 21 startups considerando a ordem cronológica da demonstração de interesse, inovação do projeto, impacto social, econômico, ambiental, equipe e demonstração de comprometimento na participação do programa.

Na quarta fase ocorre um a apresentação pública final para coordenadores da FAPESP, participantes do programa e convidados, incluindo parceiros estratégicos e investidores.

Na terceira fase ocorre a definição dos mentores de cada startup, considerando as startups selecionadas, os coordenadores buscam identificar o mentor disponível mais adequado a cada uma das equipes.