Ferida operatória: indicada a realização da coleta a partir do debridamento da mesma.

Pesquisa de Treponema pallidum: indicada a limpeza da superfície da lesão com gaze estéril; pressionar a base da lesão até o surgimento de um fluido claro e, com o auxílio de alça descartável, realizar a coleta do fluido.

Escarro expectorado: indicada a realização da coleta, preferencialmente da primeira amostra da manhã; não se deve enxaguar a boca para não diminuir a concentração bacteriana.

Pesquisa de Neisseria gonorrhoeae em mulheres: indicada a coleta com swab vaginal.

Conjuntivite: indicada a coleta, com swab, da secreção da parte externa do olho.