As embalagens de Tyvek são incompatíveis com o plasma, devendo-se utilizar obrigatoriamente papel grau cirúrgico ou papel crepado para garantir a penetração do gás.

O método é compatível com todos os tipos de materiais, incluindo líquidos e pós, pois o vácuo profundo remove qualquer umidade residual antes da injeção do peróxido.

O plasma de peróxido de hidrogênio não pode esterilizar plásticos e borrachas, sendo indicado exclusivamente para metais inoxidáveis de alta densidade.

É proibido o uso de embalagens contendo celulose (papel grau cirúrgico, campos de algodão ou madeira) na esterilização por plasma, pois a celulose absorve o peróxido de hidrogênio, abortando o ciclo e comprometendo a eficácia da esterilização; deve-se usar Tyvek (poliolefina) ou polipropileno.

A restrição principal é o uso de caixas perfuradas de alumínio, que bloqueiam a passagem das ondas de radiofrequência necessárias para gerar o plasma.