O tratamento de amostras do trato respiratório para eliminação da microbiota normal e concentração de micobactérias é importante para aumentar a sensibilidade da cultura. Por outro lado, o efeito letal dos métodos de descontaminação deve ser minimizado e a concentração de micobactérias deve ser maximizada por centrifugação, sempre considerando a segurança do analista. Devem ser utilizados, portanto: