Uma pequena fração de matéria orgânica é preservada nos sedimentos. Os ambientes mais favoráveis a preservação de matéria orgânica são os ambientes anóxicos, como mares restritos e lagos profundos.

Uma rocha geradora deve ter no mínimo um teor de 5% de carbono orgânico total para a geração de hidrocarbonetos.

O querogênio do Tipo I é rico em carbono (alta razão C/H) e derivado principalmente de lipídeos de origem algálica. Comumente são encontrados em rochas geradoras depositadas em ambiente marinho e é o que possui o maior potencial para a geração de petróleo.

Após a geração de querogênio e com o prosseguimento da sedimentação ocorre o aumento da temperatura e pressão. Ocorre então a fase de catagênese, quando, ocorre a formação de óleo ou gás à depender do tipo de matéria orgânica e da temperatura.