As análises metabolômicas contam com ferramentas analíticas de alta resolução e sensibilidade para geração de grandes bancos de dados. Com uma geração de enormes quantidades de dados, vários são os bancos disponíveis para alimentarem as ferramentas de análise metabolômica por bioinformática. Com relação aos bancos de dados e para uma melhor cobertura das análises metabolômicas, podemos afirmar que: