Em seguida à inserção do DNA plasmidial em bactérias, o técnico coleta algumas colônias em placas de ágar e, após crescimento em meio líquido, isola novamente os DNAs correspondentes a cada colônia (numeradas de I a V). Para confirmar possuir o DNA correto, realiza uma digestão com enzimas de restrição para remoção do inserto dos plasmídeos correspondentes a cada colônia e em seguida corre um gel de agarose, como mostrado abaixo.
(PM: padrão de peso molecular)
Ele nota que o produto da digestão contida na faixa V é bem diferente dos demais. Isso porque o inserto em V tem:
