Proteoma envolve o estudo em larga escala de proteína, particularmente da sua estrutura e função. Ele é considerado mais complexo que o genoma, o qual é visto como uma etapa posterior. Enquanto o genoma estrutural é mais constante, o proteoma difere de célula para célula e apresenta constante mudanças por meio das interações bioquímicas com o genoma e o ambiente.