Materiais usados em análises e culturas microbianas, devem ser autoclavados durante 30 minutos, a uma temperatura de 10°C.

Após a esterilização do material contaminado, os meios de cultura ainda não solidificados são colocados no lixo comum, e a vidraria com água quente, e deixa durante 12 horas em solução de detergente.

Lâminas e lamínulas quando retiradas do microscópio, são colocadas em uma solução desinfetante (hipoclorito de sódio) e deixado submersa por 24 horas antes de serem lavados com água corrente e com água destilada.

Materiais quando novos e usados (previamente esterilizados), são lavados com solução de hipoclorito de sódio e passados sob água corrente (5 a 8 enxágues).

Os materiais devem ser deixados na estufa, após os enxágues, escorrendo em uma temperatura controlada em torno de – 15°C para secagem.