em canais com exsudação e sintomatologia persistente cujos procedimentos intracanais não forem suficientes para eliminação da infecção, pode-se empregar antibióticos.

a profilaxia antibiótica está indicada para pacientes soropositivos para HIV que precisam de tratamento endodôntico.

na presença de trismo e abscessos perirradiculares, não se deve receitar antibiótico, pois o paciente não apresenta risco de infecção disseminada ou efeitos sistêmicos.

em abscesso perirradicular agudo com tumefações localizadas, em pacientes saudáveis, indica-se tratamento através de drenagem via incisão ou via canal e administração de antibióticos de largo espectro.

de acordo com a IADT, em casos de reimplante dentário de dentes avulsionados, o uso de antibióticos não é necessário.