Há um determinado processo em que, segundo Kerbauy (2004), os elétrons são transferidos para complexos proteicos que possuem potencial de óxido-redução cada vez mais baixos. Associado a essa transferência de elétrons, há um fluxo de prótons (H+) da matriz para o espaço entre as membranas da mitocôndria. Ao final, cada par de elétrons é doado para um oxigênio (½O2) junto com dois prótons (H+), formando moléculas 2 de água. Esse processo é chamado:
