No esmalte dental, as proteínas amelogenina distribuem-se em paralelo ao seu longo eixo, favorecendo a formação dos primas, após a mineralização.

Na camada de dentina, as proteínas de colágeno organizam-se em rede entrelaçada, permitindo que a mineralização ocorra formando canais.

No cemento, o grau de mineralização da porção acelular afibrilar é menor do que na porção fibrilar, pela vantagem anatômica e estrutural da região.

Quando restos radiculares da bainha epitelial de Hertwig permanecem aderidos à raiz após apoptose, pode-se gerar depósito de material semelhante ao esmalte, denominando-se pérolas de esmalte.

Pode-se citar como componentes orgânicos do cemento: colágeno tipo I, fosfoproteínas, osteocalcina, sialoproteína, glicosaminaglicanas.