Quando há suspeita de infecção por micobactérias, a coloração de Gram não deve ser utilizada.

A técnica de Kinyoun tem como fundamento a impregnação de espiroquetas pela prata.

A coloração de Ziehl-Nielsen utiliza os fluorocromos auramina e rodamina para a pesquisa de micobactérias.

Na coloração de Gram, após a coloração com cristal violeta, somente as bactérias Gram positivas ficarão róseas.

A coloração de Fontana-Tribondeau utiliza solução de nitrato de prata, cuja visualização é realizada com o condensador de campo escuro.