Para a obtenção de cortes histológicos, o primeiro passo é fazer a microtomia do material coletado, estimulando a autólise e preservando a composição química do tecido.

Para a formação da imagem no microscópio de luz, o material biológico deve ser fino o suficiente para que a luz possa atravessá-lo.

O material biológico deve ser endurecido para ser cortado, o que é possível incluindo-o em uma substância que se solidifica depois de penetrá-lo, como, por exemplo, a parafina.

Como os tecidos são geralmente incolores, os histologistas inventaram soluções corantes que têm afinidades diferentes para certas organelas e estruturas, possibilitando a sua localização.

Para o material ser corado, a parafina deve ser dissolvida, o que é obtido ao se colocar a lâmina em xilol, e o tecido precisa ser hidratado, já que esses corantes são solúveis em água. A hidratação é conseguida passando a lâmina em uma série alcoólica decrescente e em água.