A Bahia estava dividida, assim como o Pará. Uma parte significativa da sua elite tinha grandes negócios com Portugal e, por isso, temendo a sua ruina, solicitou à Coroa portuguesa o envio de um grande continente de soldados portugueses, o que dificultou sua expulsão.

O temor de novos levantes de escravos, interessados na sua libertação e da Bahia, levou a Coroa portuguesa a estacionar nela um grande contingente bem armado, o que veio dificultar a ação dos patriotas na tomada do poder.

Os ingleses, aliados dos portugueses, não queriam perder o comércio com a Bahia, o mais rico da colônia, pressionando, por isso, a Coroa portuguesa para que mantivesse nela um grande contingente acantonado. Essas tropas, leais a Portugal, não aceitaram a emancipação.

A Bahia era a capitania mais rica do Brasil e Salvador era o principal porto do Brasil, o que explica o grande contingente de tropas nela acantonadas e sua resistência.

A localização da Bahia tornava-a um ponto estratégico importante, tanto pela proximidade com Portugal como para a rota marítima em direção ao Sul e às Índias. Por esse motivo, sempre houve um grande contingente de tropas leais a Portugal, que resistiram por ocasião do processo de emancipação.