Na prática clínica, o diagnóstico preliminar de Transtorno Esquizoafetivo costuma ser empregado quando o clínico não tem certeza do diagnóstico.

O tipo depressivo do transtorno é mais comum em pessoas mais jovens do que nos mais velhos, e o tipo bipolar é mais comum em pessoas mais velhas do que em adultos jovens.

Segundo o DSM-IV-TR, é necessário que ocorram sintomas proeminentes de humor por um período mínimo de duas semanas, na ausência de delírios ou alucinações para que seja preenchido um dos critérios diagnósticos para o transtorno.

Pacientes que têm um episódio maníaco completo com dois meses de duração, mas que sofreram sintomas de esquizofrenia por 10 anos, satisfazem os critérios para Transtorno Esquizoafetivo.

A prevalência do transtorno é mais baixa em homens do que em mulheres, particularmente casadas; a idade de início para eles é mais tardia do que para as mulheres, assemelhando-se ao Transtorno Bipolar.